Виходячи з характеру впливу, иммунизирующими і захисними (профілактичними).
Виходячи з цілей застосування, описувані препарати поділяються на наступні класи:
- Протравлювачі насіння. Засоби широкого спектру дії мінімізують регулярність обробки вегетуючих сільгосп культур.
- Знезаражувачі землі. З допомогою таких фунгіцидів зазвичай захищають однорічні рослини, що висадились розсадою. Ці препарати мають хорошу летючість, тому діють парами і газами.
- Обробники посіву під час вегетації. Дані пестициди використовуються під час вразливих фаз розвитку грибкових спор.
- Для періоду спокою. Ці фунгіциди захищають багаторічні культури, усуваючи грибкових збудників в зимовий час.